Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN5P54829 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN5P54829 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN5P54829 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPN5P54829 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPN5P54829 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPN5P54829 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN5P54829 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms