Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RAD23AP54725 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RAD23AP54725 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms