Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ATXN3P54252 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATXN3P54252 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATXN3P54252 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATXN3P54252 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATXN3P54252 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms