Protein–RNA interactions for Protein: P53855

ATG2, Autophagy-related protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG2P53855 VPS15YBR097W 4365 nt2.1□□□□□ -2.07
ATG2P53855 AEP2YMR282C 1743 nt2.1□□□□□ -2.07
ATG2P53855 REV1YOR346W 2958 nt2.1□□□□□ -2.07
ATG2P53855 SEC3YER008C 4011 nt2.1□□□□□ -2.07
ATG2P53855 SPC98YNL126W 2541 nt2.1□□□□□ -2.07
ATG2P53855 RSM25YIL093C 795 nt2.1□□□□□ -2.07
ATG2P53855 YJR061WYJR061W 2808 nt2.09□□□□□ -2.07
ATG2P53855 YJL113WYJL113W 4647 nt2.09□□□□□ -2.08
ATG2P53855 ECM1YAL059W 639 nt2.09□□□□□ -2.08
ATG2P53855 YKR023WYKR023W 1593 nt2.08□□□□□ -2.08
ATG2P53855 NRG2YBR066C 663 nt2.08□□□□□ -2.08
ATG2P53855 YPR097WYPR097W 3222 nt2.07□□□□□ -2.08
ATG2P53855 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt2.07□□□□□ -2.08
ATG2P53855 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.07□□□□□ -2.08
ATG2P53855 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt2.07□□□□□ -2.08
ATG2P53855 APM1YPL259C 1428 nt2.07□□□□□ -2.08
ATG2P53855 MTR2YKL186C 555 nt2.06□□□□□ -2.08
ATG2P53855 YLR422WYLR422W 5799 nt2.06□□□□□ -2.08
ATG2P53855 YCK3YER123W 1575 nt2.06□□□□□ -2.08
ATG2P53855 YJR003CYJR003C 1560 nt2.06□□□□□ -2.08
ATG2P53855 MCT1YOR221C 1083 nt2.06□□□□□ -2.08
ATG2P53855 OCT1YKL134C 2319 nt2.05□□□□□ -2.08
ATG2P53855 SPR28YDR218C 1272 nt2.05□□□□□ -2.08
ATG2P53855 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt2.05□□□□□ -2.08
ATG2P53855 CSE4YKL049C 690 nt2.05□□□□□ -2.08
ATG2P53855 YPR077CYPR077C 372 nt2.05□□□□□ -2.08
ATG2P53855 YCK2YNL154C 1641 nt2.05□□□□□ -2.08
ATG2P53855 SIP4YJL089W 2490 nt2.04□□□□□ -2.08
ATG2P53855 SCL1YGL011C 759 nt2.04□□□□□ -2.08
ATG2P53855 RRF1YHR038W 693 nt2.04□□□□□ -2.08
ATG2P53855 SHE2YKL130C 741 nt2.04□□□□□ -2.08
ATG2P53855 ESF2YNR054C 951 nt2.04□□□□□ -2.08
ATG2P53855 YOR238WYOR238W 912 nt2.04□□□□□ -2.08
ATG2P53855 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt2.04□□□□□ -2.08
ATG2P53855 UBX3YDL091C 1368 nt2.03□□□□□ -2.08
ATG2P53855 PLP1YDR183W 693 nt2.03□□□□□ -2.08
ATG2P53855 MRPL27YBR282W 441 nt2.03□□□□□ -2.08
ATG2P53855 GRX1YCL035C 333 nt2.03□□□□□ -2.08
ATG2P53855 DEF1YKL054C 2217 nt2.03□□□□□ -2.08
ATG2P53855 FYV8YGR196C 2454 nt2.03□□□□□ -2.08
ATG2P53855 MYO2YOR326W 4725 nt2.03□□□□□ -2.08
ATG2P53855 YIR014WYIR014W 729 nt2.02□□□□□ -2.09
ATG2P53855 SEN15YMR059W 387 nt2.02□□□□□ -2.09
ATG2P53855 YMR141CYMR141C 309 nt2.02□□□□□ -2.09
ATG2P53855 MMS22YLR320W 4365 nt2.01□□□□□ -2.09
ATG2P53855 NPL4YBR170C 1743 nt2.01□□□□□ -2.09
ATG2P53855 BUD3YCL014W 4911 nt2.01□□□□□ -2.09
ATG2P53855 ZRG17YNR039C 1818 nt2□□□□□ -2.09
ATG2P53855 LDB17YDL146W 1476 nt2□□□□□ -2.09
ATG2P53855 COS4YFL062W 1140 nt2□□□□□ -2.09
ATG2P53855 PRP38YGR075C 729 nt2□□□□□ -2.09
ATG2P53855 CYC2YOR037W 1101 nt2□□□□□ -2.09
ATG2P53855 MSN5YDR335W 3675 nt1.99□□□□□ -2.09
ATG2P53855 PET309YLR067C 2898 nt1.99□□□□□ -2.09
ATG2P53855 UBR1YGR184C 5853 nt1.99□□□□□ -2.09
ATG2P53855 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.99□□□□□ -2.09
ATG2P53855 PSY3YLR376C 729 nt1.99□□□□□ -2.09
ATG2P53855 ELG1YOR144C 2376 nt1.99□□□□□ -2.09
ATG2P53855 UBC6YER100W 753 nt1.98□□□□□ -2.09
ATG2P53855 SKN7YHR206W 1869 nt1.98□□□□□ -2.09
ATG2P53855 DOP1YDR141C 5097 nt1.98□□□□□ -2.09
ATG2P53855 INP51YIL002C 2841 nt1.98□□□□□ -2.09
ATG2P53855 REG1YDR028C 3045 nt1.98□□□□□ -2.09
ATG2P53855 MSL1YIR009W 336 nt1.98□□□□□ -2.09
ATG2P53855 HIT1YJR055W 495 nt1.98□□□□□ -2.09
ATG2P53855 SVS1YPL163C 783 nt1.98□□□□□ -2.09
ATG2P53855 YDL073WYDL073W 2955 nt1.97□□□□□ -2.09
ATG2P53855 YGR242WYGR242W 309 nt1.97□□□□□ -2.09
ATG2P53855 PPE1YHR075C 1203 nt1.97□□□□□ -2.09
ATG2P53855 EST3YIL009C-A 546 nt1.97□□□□□ -2.09
ATG2P53855 YLR428CYLR428C 345 nt1.97□□□□□ -2.09
ATG2P53855 ARR2YPR200C 393 nt1.97□□□□□ -2.09
ATG2P53855 CDC53YDL132W 2448 nt1.97□□□□□ -2.09
ATG2P53855 YRR1YOR162C 2433 nt1.97□□□□□ -2.09
ATG2P53855 MRE11YMR224C 2079 nt1.96□□□□□ -2.09
ATG2P53855 YEL1YBL060W 2064 nt1.96□□□□□ -2.09
ATG2P53855 RDS2YPL133C 1341 nt1.96□□□□□ -2.1
ATG2P53855 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt1.96□□□□□ -2.1
ATG2P53855 SPC3YLR066W 555 nt1.96□□□□□ -2.1
ATG2P53855 ATP11YNL315C 957 nt1.96□□□□□ -2.1
ATG2P53855 RRP14YKL082C 1305 nt1.96□□□□□ -2.1
ATG2P53855 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.95□□□□□ -2.1
ATG2P53855 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.95□□□□□ -2.1
ATG2P53855 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.94□□□□□ -2.1
ATG2P53855 REC102YLR329W 795 nt1.94□□□□□ -2.1
ATG2P53855 SEC65YML105C 822 nt1.94□□□□□ -2.1
ATG2P53855 YOL166CYOL166C 339 nt1.94□□□□□ -2.1
ATG2P53855 SPO22YIL073C 2928 nt1.94□□□□□ -2.1
ATG2P53855 DDI2YFL061W 678 nt1.93□□□□□ -2.1
ATG2P53855 YJL119CYJL119C 324 nt1.93□□□□□ -2.1
ATG2P53855 RPL33BYOR234C 324 nt1.93□□□□□ -2.1
ATG2P53855 CTP1YBR291C 900 nt1.93□□□□□ -2.1
ATG2P53855 FIN1YDR130C 876 nt1.92□□□□□ -2.1
ATG2P53855 YHR097CYHR097C 1101 nt1.92□□□□□ -2.1
ATG2P53855 MSS116YDR194C 1995 nt1.92□□□□□ -2.1
ATG2P53855 SMY2YBR172C 2223 nt1.92□□□□□ -2.1
ATG2P53855 KCS1YDR017C 3153 nt1.91□□□□□ -2.1
ATG2P53855 PUF2YPR042C 3228 nt1.91□□□□□ -2.1
ATG2P53855 YOL162WYOL162W 648 nt1.91□□□□□ -2.1
ATG2P53855 PIS1YPR113W 663 nt1.91□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 59.3 ms