Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ARFIP1P53367 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ARFIP1P53367 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ARFIP1P53367 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ARFIP1P53367 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARFIP1P53367 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARFIP1P53367 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARFIP1P53367 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARFIP1P53367 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARFIP1P53367 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARFIP1P53367 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ARFIP1P53367 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms