Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBX2P52951 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBX2P52951 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBX2P52951 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBX2P52951 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBX2P52951 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBX2P52951 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBX2P52951 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBX2P52951 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBX2P52951 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBX2P52951 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBX2P52951 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBX2P52951 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBX2P52951 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBX2P52951 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBX2P52951 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBX2P52951 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBX2P52951 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBX2P52951 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBX2P52951 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBX2P52951 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBX2P52951 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBX2P52951 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBX2P52951 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBX2P52951 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBX2P52951 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBX2P52951 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBX2P52951 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBX2P52951 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GBX2P52951 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBX2P52951 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBX2P52951 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GBX2P52951 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBX2P52951 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBX2P52951 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBX2P52951 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBX2P52951 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBX2P52951 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBX2P52951 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBX2P52951 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX2P52951 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX2P52951 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX2P52951 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX2P52951 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX2P52951 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX2P52951 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX2P52951 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX2P52951 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX2P52951 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX2P52951 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX2P52951 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX2P52951 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX2P52951 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX2P52951 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX2P52951 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX2P52951 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX2P52951 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX2P52951 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX2P52951 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX2P52951 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX2P52951 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX2P52951 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX2P52951 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBX2P52951 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX2P52951 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX2P52951 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX2P52951 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX2P52951 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX2P52951 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX2P52951 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX2P52951 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX2P52951 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX2P52951 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX2P52951 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX2P52951 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX2P52951 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX2P52951 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX2P52951 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX2P52951 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX2P52951 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX2P52951 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX2P52951 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX2P52951 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX2P52951 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX2P52951 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX2P52951 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX2P52951 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX2P52951 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBX2P52951 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBX2P52951 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBX2P52951 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBX2P52951 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBX2P52951 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBX2P52951 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBX2P52951 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBX2P52951 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBX2P52951 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBX2P52951 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBX2P52951 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBX2P52951 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms