Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDR1P51861 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDR1P51861 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDR1P51861 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDR1P51861 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDR1P51861 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDR1P51861 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDR1P51861 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDR1P51861 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDR1P51861 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDR1P51861 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDR1P51861 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDR1P51861 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDR1P51861 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDR1P51861 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDR1P51861 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDR1P51861 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDR1P51861 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDR1P51861 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDR1P51861 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDR1P51861 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDR1P51861 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDR1P51861 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDR1P51861 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDR1P51861 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDR1P51861 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDR1P51861 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDR1P51861 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDR1P51861 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDR1P51861 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDR1P51861 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDR1P51861 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDR1P51861 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDR1P51861 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDR1P51861 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDR1P51861 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDR1P51861 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDR1P51861 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDR1P51861 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDR1P51861 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDR1P51861 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDR1P51861 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDR1P51861 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDR1P51861 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDR1P51861 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDR1P51861 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDR1P51861 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDR1P51861 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDR1P51861 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDR1P51861 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDR1P51861 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDR1P51861 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDR1P51861 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDR1P51861 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDR1P51861 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDR1P51861 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDR1P51861 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDR1P51861 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDR1P51861 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDR1P51861 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDR1P51861 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDR1P51861 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDR1P51861 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDR1P51861 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDR1P51861 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDR1P51861 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDR1P51861 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDR1P51861 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDR1P51861 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDR1P51861 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDR1P51861 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDR1P51861 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDR1P51861 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDR1P51861 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDR1P51861 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDR1P51861 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDR1P51861 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDR1P51861 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDR1P51861 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDR1P51861 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDR1P51861 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDR1P51861 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDR1P51861 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDR1P51861 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDR1P51861 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDR1P51861 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDR1P51861 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDR1P51861 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDR1P51861 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDR1P51861 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDR1P51861 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDR1P51861 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDR1P51861 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDR1P51861 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDR1P51861 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDR1P51861 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDR1P51861 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDR1P51861 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDR1P51861 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDR1P51861 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms