Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DAP3P51398 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DAP3P51398 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DAP3P51398 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DAP3P51398 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DAP3P51398 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DAP3P51398 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DAP3P51398 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DAP3P51398 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DAP3P51398 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DAP3P51398 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DAP3P51398 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DAP3P51398 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DAP3P51398 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DAP3P51398 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DAP3P51398 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DAP3P51398 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DAP3P51398 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DAP3P51398 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DAP3P51398 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DAP3P51398 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DAP3P51398 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DAP3P51398 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DAP3P51398 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DAP3P51398 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DAP3P51398 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DAP3P51398 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DAP3P51398 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
DAP3P51398 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
DAP3P51398 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DAP3P51398 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DAP3P51398 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DAP3P51398 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DAP3P51398 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DAP3P51398 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DAP3P51398 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DAP3P51398 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DAP3P51398 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DAP3P51398 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DAP3P51398 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DAP3P51398 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DAP3P51398 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DAP3P51398 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DAP3P51398 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DAP3P51398 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DAP3P51398 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DAP3P51398 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DAP3P51398 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DAP3P51398 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DAP3P51398 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DAP3P51398 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DAP3P51398 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DAP3P51398 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DAP3P51398 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DAP3P51398 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DAP3P51398 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DAP3P51398 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DAP3P51398 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DAP3P51398 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DAP3P51398 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DAP3P51398 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DAP3P51398 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DAP3P51398 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DAP3P51398 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DAP3P51398 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DAP3P51398 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DAP3P51398 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DAP3P51398 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DAP3P51398 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DAP3P51398 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DAP3P51398 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DAP3P51398 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DAP3P51398 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DAP3P51398 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DAP3P51398 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DAP3P51398 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DAP3P51398 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DAP3P51398 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DAP3P51398 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DAP3P51398 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DAP3P51398 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DAP3P51398 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DAP3P51398 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DAP3P51398 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DAP3P51398 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DAP3P51398 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DAP3P51398 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DAP3P51398 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DAP3P51398 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DAP3P51398 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DAP3P51398 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DAP3P51398 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DAP3P51398 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DAP3P51398 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DAP3P51398 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DAP3P51398 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DAP3P51398 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DAP3P51398 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DAP3P51398 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DAP3P51398 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms