Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCNN1GP51170 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1GP51170 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms