Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms