Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERFP50548 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERFP50548 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERFP50548 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERFP50548 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERFP50548 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ERFP50548 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERFP50548 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERFP50548 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERFP50548 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERFP50548 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERFP50548 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERFP50548 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERFP50548 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERFP50548 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ERFP50548 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERFP50548 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERFP50548 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERFP50548 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERFP50548 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERFP50548 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERFP50548 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERFP50548 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERFP50548 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERFP50548 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERFP50548 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERFP50548 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERFP50548 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERFP50548 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERFP50548 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERFP50548 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERFP50548 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERFP50548 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERFP50548 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERFP50548 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERFP50548 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERFP50548 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERFP50548 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERFP50548 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERFP50548 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERFP50548 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERFP50548 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERFP50548 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERFP50548 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERFP50548 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERFP50548 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERFP50548 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERFP50548 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERFP50548 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERFP50548 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERFP50548 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERFP50548 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERFP50548 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERFP50548 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERFP50548 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERFP50548 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERFP50548 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERFP50548 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERFP50548 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERFP50548 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ERFP50548 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERFP50548 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERFP50548 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERFP50548 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERFP50548 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERFP50548 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERFP50548 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERFP50548 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERFP50548 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERFP50548 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERFP50548 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERFP50548 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERFP50548 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ERFP50548 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERFP50548 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERFP50548 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ERFP50548 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERFP50548 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERFP50548 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERFP50548 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERFP50548 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERFP50548 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERFP50548 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERFP50548 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERFP50548 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERFP50548 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERFP50548 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERFP50548 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERFP50548 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERFP50548 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERFP50548 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERFP50548 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERFP50548 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERFP50548 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERFP50548 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ERFP50548 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERFP50548 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERFP50548 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERFP50548 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERFP50548 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms