Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms