Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD2P49005 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD2P49005 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD2P49005 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD2P49005 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD2P49005 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD2P49005 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLD2P49005 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLD2P49005 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLD2P49005 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLD2P49005 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLD2P49005 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLD2P49005 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD2P49005 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD2P49005 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD2P49005 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD2P49005 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD2P49005 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD2P49005 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD2P49005 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD2P49005 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD2P49005 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLD2P49005 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD2P49005 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD2P49005 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD2P49005 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD2P49005 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD2P49005 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD2P49005 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD2P49005 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD2P49005 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD2P49005 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD2P49005 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD2P49005 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD2P49005 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD2P49005 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD2P49005 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD2P49005 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD2P49005 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD2P49005 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD2P49005 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD2P49005 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD2P49005 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD2P49005 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD2P49005 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD2P49005 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLD2P49005 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD2P49005 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD2P49005 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD2P49005 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD2P49005 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD2P49005 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD2P49005 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD2P49005 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD2P49005 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD2P49005 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD2P49005 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD2P49005 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD2P49005 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD2P49005 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLD2P49005 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD2P49005 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD2P49005 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD2P49005 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD2P49005 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD2P49005 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD2P49005 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD2P49005 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD2P49005 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD2P49005 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD2P49005 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD2P49005 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD2P49005 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD2P49005 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD2P49005 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD2P49005 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD2P49005 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD2P49005 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLD2P49005 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLD2P49005 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLD2P49005 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLD2P49005 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLD2P49005 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLD2P49005 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLD2P49005 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLD2P49005 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLD2P49005 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLD2P49005 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLD2P49005 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLD2P49005 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLD2P49005 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLD2P49005 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
POLD2P49005 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLD2P49005 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLD2P49005 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLD2P49005 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLD2P49005 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLD2P49005 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
POLD2P49005 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
POLD2P49005 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms