Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP5P45974 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP5P45974 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP5P45974 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP5P45974 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP5P45974 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP5P45974 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP5P45974 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP5P45974 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP5P45974 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP5P45974 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP5P45974 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP5P45974 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
USP5P45974 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP5P45974 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP5P45974 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP5P45974 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP5P45974 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP5P45974 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
USP5P45974 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
USP5P45974 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP5P45974 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP5P45974 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP5P45974 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP5P45974 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP5P45974 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP5P45974 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP5P45974 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP5P45974 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP5P45974 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP5P45974 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP5P45974 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP5P45974 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP5P45974 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP5P45974 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP5P45974 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP5P45974 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP5P45974 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP5P45974 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP5P45974 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP5P45974 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP5P45974 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP5P45974 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP5P45974 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP5P45974 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP5P45974 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP5P45974 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP5P45974 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP5P45974 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP5P45974 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP5P45974 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP5P45974 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP5P45974 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP5P45974 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP5P45974 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP5P45974 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP5P45974 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP5P45974 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP5P45974 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP5P45974 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP5P45974 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP5P45974 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP5P45974 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP5P45974 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP5P45974 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP5P45974 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP5P45974 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP5P45974 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP5P45974 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
USP5P45974 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP5P45974 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
USP5P45974 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP5P45974 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP5P45974 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP5P45974 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP5P45974 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP5P45974 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP5P45974 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP5P45974 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP5P45974 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP5P45974 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP5P45974 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP5P45974 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP5P45974 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP5P45974 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP5P45974 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP5P45974 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP5P45974 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP5P45974 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP5P45974 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP5P45974 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP5P45974 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP5P45974 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP5P45974 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP5P45974 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP5P45974 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
USP5P45974 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
USP5P45974 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
USP5P45974 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
USP5P45974 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms