Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNA4P43681 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms