Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGIRP43119 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms