Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GDF5P43026 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GDF5P43026 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GDF5P43026 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GDF5P43026 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GDF5P43026 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GDF5P43026 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GDF5P43026 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GDF5P43026 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDF5P43026 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDF5P43026 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDF5P43026 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDF5P43026 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDF5P43026 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDF5P43026 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDF5P43026 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDF5P43026 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDF5P43026 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDF5P43026 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDF5P43026 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDF5P43026 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDF5P43026 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDF5P43026 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDF5P43026 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDF5P43026 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDF5P43026 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GDF5P43026 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDF5P43026 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDF5P43026 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDF5P43026 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDF5P43026 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDF5P43026 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDF5P43026 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDF5P43026 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDF5P43026 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDF5P43026 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDF5P43026 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDF5P43026 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDF5P43026 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDF5P43026 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDF5P43026 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDF5P43026 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDF5P43026 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDF5P43026 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDF5P43026 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDF5P43026 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDF5P43026 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDF5P43026 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDF5P43026 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDF5P43026 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDF5P43026 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDF5P43026 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDF5P43026 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDF5P43026 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDF5P43026 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDF5P43026 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDF5P43026 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDF5P43026 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDF5P43026 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDF5P43026 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDF5P43026 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDF5P43026 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDF5P43026 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDF5P43026 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDF5P43026 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDF5P43026 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDF5P43026 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDF5P43026 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDF5P43026 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDF5P43026 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDF5P43026 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDF5P43026 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDF5P43026 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GDF5P43026 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDF5P43026 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GDF5P43026 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDF5P43026 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDF5P43026 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDF5P43026 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GDF5P43026 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDF5P43026 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDF5P43026 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDF5P43026 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDF5P43026 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDF5P43026 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDF5P43026 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDF5P43026 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDF5P43026 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDF5P43026 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GDF5P43026 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDF5P43026 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDF5P43026 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDF5P43026 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDF5P43026 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDF5P43026 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDF5P43026 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDF5P43026 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GDF5P43026 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GDF5P43026 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GDF5P43026 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms