Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIA2P42262 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms