Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDH1P40925 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDH1P40925 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDH1P40925 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDH1P40925 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDH1P40925 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDH1P40925 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDH1P40925 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDH1P40925 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDH1P40925 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDH1P40925 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDH1P40925 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDH1P40925 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDH1P40925 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDH1P40925 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MDH1P40925 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MDH1P40925 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MDH1P40925 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MDH1P40925 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MDH1P40925 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MDH1P40925 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
MDH1P40925 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MDH1P40925 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MDH1P40925 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MDH1P40925 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MDH1P40925 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MDH1P40925 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MDH1P40925 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MDH1P40925 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MDH1P40925 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MDH1P40925 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDH1P40925 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDH1P40925 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDH1P40925 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDH1P40925 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDH1P40925 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDH1P40925 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDH1P40925 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDH1P40925 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDH1P40925 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDH1P40925 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDH1P40925 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDH1P40925 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDH1P40925 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MDH1P40925 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDH1P40925 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDH1P40925 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDH1P40925 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDH1P40925 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDH1P40925 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDH1P40925 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDH1P40925 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDH1P40925 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDH1P40925 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MDH1P40925 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDH1P40925 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MDH1P40925 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDH1P40925 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDH1P40925 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDH1P40925 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDH1P40925 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDH1P40925 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDH1P40925 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDH1P40925 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDH1P40925 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDH1P40925 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDH1P40925 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDH1P40925 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDH1P40925 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDH1P40925 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDH1P40925 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDH1P40925 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDH1P40925 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDH1P40925 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDH1P40925 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDH1P40925 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDH1P40925 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDH1P40925 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDH1P40925 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDH1P40925 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDH1P40925 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDH1P40925 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MDH1P40925 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDH1P40925 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MDH1P40925 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MDH1P40925 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MDH1P40925 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MDH1P40925 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MDH1P40925 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MDH1P40925 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MDH1P40925 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MDH1P40925 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MDH1P40925 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MDH1P40925 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MDH1P40925 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MDH1P40925 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MDH1P40925 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MDH1P40925 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MDH1P40925 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MDH1P40925 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.6 ms