Protein–RNA interactions for Protein: P40547

VID28, Vacuolar import and degradation protein 28, yeastyeast

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VID28P40547 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt3.78□□□□□ -1.8
VID28P40547 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt3.78□□□□□ -1.8
VID28P40547 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt3.78□□□□□ -1.8
VID28P40547 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt3.78□□□□□ -1.8
VID28P40547 YDR199WYDR199W 366 nt3.78□□□□□ -1.8
VID28P40547 YFL065CYFL065C 309 nt3.78□□□□□ -1.8
VID28P40547 VMA10YHR039C-A 345 nt3.78□□□□□ -1.8
VID28P40547 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt3.78□□□□□ -1.8
VID28P40547 VAM10YOR068C 345 nt3.78□□□□□ -1.8
VID28P40547 RPC40YPR110C 1008 nt3.78□□□□□ -1.8
VID28P40547 SPR3YGR059W 1539 nt3.78□□□□□ -1.8
VID28P40547 REC8YPR007C 2043 nt3.78□□□□□ -1.8
VID28P40547 MIG3YER028C 1185 nt3.77□□□□□ -1.81
VID28P40547 YGR228WYGR228W 345 nt3.77□□□□□ -1.81
VID28P40547 SCEIQ0160 708 nt3.77□□□□□ -1.81
VID28P40547 CIC1YHR052W 1131 nt3.77□□□□□ -1.81
VID28P40547 POG1YIL122W 1056 nt3.77□□□□□ -1.81
VID28P40547 YIL141WYIL141W 390 nt3.77□□□□□ -1.81
VID28P40547 SDL1YIL167W 633 nt3.77□□□□□ -1.81
VID28P40547 YJR157WYJR157W 363 nt3.77□□□□□ -1.81
VID28P40547 YLR257WYLR257W 966 nt3.77□□□□□ -1.81
VID28P40547 GIS2YNL255C 462 nt3.77□□□□□ -1.81
VID28P40547 YPL205CYPL205C 345 nt3.77□□□□□ -1.81
VID28P40547 SCD6YPR129W 1050 nt3.77□□□□□ -1.81
VID28P40547 IMD4YML056C 1575 nt3.76□□□□□ -1.81
VID28P40547 MXR1YER042W 555 nt3.76□□□□□ -1.81
VID28P40547 TDA2YER071C 381 nt3.76□□□□□ -1.81
VID28P40547 SPT2YER161C 1002 nt3.76□□□□□ -1.81
VID28P40547 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt3.76□□□□□ -1.81
VID28P40547 YOL114CYOL114C 609 nt3.76□□□□□ -1.81
VID28P40547 snR35snR35 204 nt3.76□□□□□ -1.81
VID28P40547 YJR030CYJR030C 2238 nt3.76□□□□□ -1.81
VID28P40547 ARG5,6YER069W 2592 nt3.76□□□□□ -1.81
VID28P40547 YDR089WYDR089W 2610 nt3.75□□□□□ -1.81
VID28P40547 CIN8YEL061C 3003 nt3.75□□□□□ -1.81
VID28P40547 ARF1YDL192W 546 nt3.75□□□□□ -1.81
VID28P40547 FMN1YDR236C 657 nt3.75□□□□□ -1.81
VID28P40547 MET32YDR253C 576 nt3.75□□□□□ -1.81
VID28P40547 NCB2YDR397C 441 nt3.75□□□□□ -1.81
VID28P40547 PAU10YDR542W 363 nt3.75□□□□□ -1.81
VID28P40547 PAU11YGL261C 363 nt3.75□□□□□ -1.81
VID28P40547 PAU13YHL046C 363 nt3.75□□□□□ -1.81
VID28P40547 ASG7YJL170C 630 nt3.75□□□□□ -1.81
VID28P40547 RPS21AYKR057W 264 nt3.75□□□□□ -1.81
VID28P40547 PAU4YLR461W 363 nt3.75□□□□□ -1.81
VID28P40547 RPL19BYBL027W 570 nt3.75□□□□□ -1.81
VID28P40547 UBX4YMR067C 1251 nt3.75□□□□□ -1.81
VID28P40547 SEC6YIL068C 2418 nt3.75□□□□□ -1.81
VID28P40547 AUS1YOR011W 4185 nt3.75□□□□□ -1.81
VID28P40547 AVT5YBL089W 1380 nt3.75□□□□□ -1.81
VID28P40547 YDL176WYDL176W 2127 nt3.74□□□□□ -1.81
VID28P40547 HMLALPHA2YCL067C 633 nt3.74□□□□□ -1.81
VID28P40547 MATALPHA2YCR039C 633 nt3.74□□□□□ -1.81
VID28P40547 YDR262WYDR262W 819 nt3.74□□□□□ -1.81
VID28P40547 GRX2YDR513W 432 nt3.74□□□□□ -1.81
VID28P40547 RPL30YGL030W 318 nt3.74□□□□□ -1.81
VID28P40547 RPF1YHR088W 888 nt3.74□□□□□ -1.81
VID28P40547 YHR212CYHR212C 336 nt3.74□□□□□ -1.81
VID28P40547 YJL119CYJL119C 324 nt3.74□□□□□ -1.81
VID28P40547 MCD4YKL165C 2760 nt3.74□□□□□ -1.81
VID28P40547 YAR060CYAR060C 336 nt3.74□□□□□ -1.81
VID28P40547 YNL089CYNL089C 477 nt3.74□□□□□ -1.81
VID28P40547 YNL150WYNL150W 408 nt3.74□□□□□ -1.81
VID28P40547 GCY1YOR120W 939 nt3.74□□□□□ -1.81
VID28P40547 YPL107WYPL107W 747 nt3.74□□□□□ -1.81
VID28P40547 AFT2YPL202C 1251 nt3.74□□□□□ -1.81
VID28P40547 YEL025CYEL025C 3567 nt3.74□□□□□ -1.81
VID28P40547 NSA1YGL111W 1392 nt3.74□□□□□ -1.81
VID28P40547 MIT1YEL007W 2001 nt3.73□□□□□ -1.81
VID28P40547 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt3.73□□□□□ -1.81
VID28P40547 ERG11YHR007C 1593 nt3.73□□□□□ -1.81
VID28P40547 snR56snR56 88 nt3.73□□□□□ -1.81
VID28P40547 SRD1YCR018C 666 nt3.73□□□□□ -1.81
VID28P40547 YER175W-AYER175W-A 165 nt3.73□□□□□ -1.81
VID28P40547 YGR045CYGR045C 363 nt3.73□□□□□ -1.81
VID28P40547 AGE2YIL044C 897 nt3.73□□□□□ -1.81
VID28P40547 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt3.73□□□□□ -1.81
VID28P40547 YNL184CYNL184C 327 nt3.73□□□□□ -1.81
VID28P40547 SEG1YMR086W 2883 nt3.73□□□□□ -1.81
VID28P40547 AKR1YDR264C 2295 nt3.73□□□□□ -1.81
VID28P40547 GSC2YGR032W 5688 nt3.73□□□□□ -1.81
VID28P40547 STU1YBL034C 4542 nt3.72□□□□□ -1.81
VID28P40547 YTA7YGR270W 4140 nt3.72□□□□□ -1.81
VID28P40547 CHA4YLR098C 1947 nt3.72□□□□□ -1.81
VID28P40547 VPS30YPL120W 1674 nt3.72□□□□□ -1.81
VID28P40547 BRE5YNR051C 1548 nt3.72□□□□□ -1.81
VID28P40547 CPR5YDR304C 678 nt3.72□□□□□ -1.81
VID28P40547 YGL039WYGL039W 1047 nt3.72□□□□□ -1.81
VID28P40547 PCL5YHR071W 690 nt3.72□□□□□ -1.81
VID28P40547 GEP4YHR100C 558 nt3.72□□□□□ -1.81
VID28P40547 RNH203YLR154C 333 nt3.72□□□□□ -1.81
VID28P40547 SWS2YNL081C 432 nt3.72□□□□□ -1.81
VID28P40547 MYO3YKL129C 3819 nt3.72□□□□□ -1.81
VID28P40547 RPN3YER021W 1572 nt3.72□□□□□ -1.81
VID28P40547 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt3.71□□□□□ -1.82
VID28P40547 POL4YCR014C 1749 nt3.71□□□□□ -1.82
VID28P40547 CHZ1YER030W 462 nt3.71□□□□□ -1.82
VID28P40547 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt3.71□□□□□ -1.82
VID28P40547 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt3.71□□□□□ -1.82
VID28P40547 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt3.71□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.4 ms