Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX1P40424 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX1P40424 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX1P40424 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX1P40424 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX1P40424 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX1P40424 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX1P40424 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX1P40424 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX1P40424 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX1P40424 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX1P40424 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX1P40424 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX1P40424 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX1P40424 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX1P40424 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX1P40424 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX1P40424 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX1P40424 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX1P40424 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX1P40424 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX1P40424 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX1P40424 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX1P40424 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX1P40424 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX1P40424 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX1P40424 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX1P40424 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX1P40424 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX1P40424 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX1P40424 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX1P40424 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX1P40424 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX1P40424 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX1P40424 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX1P40424 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PBX1P40424 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PBX1P40424 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PBX1P40424 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PBX1P40424 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PBX1P40424 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PBX1P40424 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PBX1P40424 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PBX1P40424 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PBX1P40424 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PBX1P40424 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PBX1P40424 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PBX1P40424 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PBX1P40424 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PBX1P40424 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PBX1P40424 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PBX1P40424 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PBX1P40424 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PBX1P40424 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PBX1P40424 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PBX1P40424 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PBX1P40424 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PBX1P40424 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PBX1P40424 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PBX1P40424 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PBX1P40424 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PBX1P40424 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PBX1P40424 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PBX1P40424 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PBX1P40424 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PBX1P40424 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PBX1P40424 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PBX1P40424 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PBX1P40424 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PBX1P40424 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PBX1P40424 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PBX1P40424 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PBX1P40424 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PBX1P40424 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PBX1P40424 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PBX1P40424 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PBX1P40424 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PBX1P40424 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PBX1P40424 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PBX1P40424 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PBX1P40424 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PBX1P40424 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PBX1P40424 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PBX1P40424 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PBX1P40424 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PBX1P40424 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PBX1P40424 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PBX1P40424 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PBX1P40424 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PBX1P40424 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PBX1P40424 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PBX1P40424 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PBX1P40424 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PBX1P40424 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PBX1P40424 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PBX1P40424 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PBX1P40424 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PBX1P40424 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PBX1P40424 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PBX1P40424 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms