Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARGP37231 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARGP37231 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARGP37231 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARGP37231 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARGP37231 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARGP37231 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARGP37231 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARGP37231 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARGP37231 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARGP37231 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARGP37231 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARGP37231 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARGP37231 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARGP37231 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARGP37231 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARGP37231 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARGP37231 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARGP37231 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARGP37231 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARGP37231 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARGP37231 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARGP37231 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARGP37231 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARGP37231 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARGP37231 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARGP37231 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARGP37231 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARGP37231 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARGP37231 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARGP37231 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARGP37231 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARGP37231 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARGP37231 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARGP37231 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARGP37231 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARGP37231 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARGP37231 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARGP37231 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARGP37231 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARGP37231 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARGP37231 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARGP37231 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARGP37231 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARGP37231 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARGP37231 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARGP37231 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARGP37231 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARGP37231 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARGP37231 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARGP37231 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARGP37231 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARGP37231 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PPARGP37231 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PPARGP37231 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPARGP37231 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPARGP37231 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPARGP37231 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPARGP37231 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPARGP37231 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPARGP37231 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPARGP37231 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPARGP37231 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPARGP37231 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPARGP37231 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPARGP37231 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPARGP37231 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPARGP37231 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPARGP37231 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPARGP37231 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPARGP37231 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPARGP37231 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPARGP37231 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPARGP37231 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPARGP37231 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPARGP37231 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPARGP37231 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPARGP37231 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPARGP37231 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPARGP37231 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPARGP37231 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPARGP37231 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPARGP37231 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPARGP37231 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPARGP37231 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPARGP37231 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPARGP37231 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPARGP37231 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPARGP37231 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPARGP37231 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPARGP37231 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPARGP37231 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPARGP37231 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPARGP37231 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPARGP37231 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPARGP37231 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPARGP37231 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPARGP37231 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPARGP37231 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPARGP37231 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms