Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDIT3P35638 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDIT3P35638 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms