Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD12P35452 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms