Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SFTPDP35247 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFTPDP35247 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms