Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNB1P35222 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms