Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA4P35212 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA4P35212 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA4P35212 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJA4P35212 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GJA4P35212 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GJA4P35212 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1
GJA4P35212 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA4P35212 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA4P35212 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA4P35212 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA4P35212 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA4P35212 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA4P35212 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA4P35212 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA4P35212 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA4P35212 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA4P35212 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA4P35212 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA4P35212 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA4P35212 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA4P35212 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA4P35212 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA4P35212 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJA4P35212 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA4P35212 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA4P35212 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA4P35212 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJA4P35212 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA4P35212 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA4P35212 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA4P35212 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA4P35212 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA4P35212 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA4P35212 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA4P35212 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA4P35212 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA4P35212 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA4P35212 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA4P35212 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA4P35212 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA4P35212 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA4P35212 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA4P35212 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA4P35212 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA4P35212 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA4P35212 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJA4P35212 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GJA4P35212 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA4P35212 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GJA4P35212 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJA4P35212 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA4P35212 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GJA4P35212 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA4P35212 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJA4P35212 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA4P35212 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJA4P35212 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA4P35212 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJA4P35212 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA4P35212 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA4P35212 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA4P35212 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJA4P35212 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJA4P35212 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJA4P35212 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GJA4P35212 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJA4P35212 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA4P35212 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GJA4P35212 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA4P35212 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GJA4P35212 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJA4P35212 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJA4P35212 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA4P35212 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJA4P35212 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJA4P35212 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA4P35212 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GJA4P35212 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA4P35212 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GJA4P35212 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA4P35212 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJA4P35212 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA4P35212 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GJA4P35212 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJA4P35212 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJA4P35212 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA4P35212 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJA4P35212 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GJA4P35212 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJA4P35212 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJA4P35212 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJA4P35212 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GJA4P35212 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GJA4P35212 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJA4P35212 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GJA4P35212 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GJA4P35212 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJA4P35212 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJA4P35212 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms