Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCR5P32302 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms