Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 AL035563.1-201ENST00000609087 1539 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 BMS1P11-201ENST00000442351 885 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 BMS1P9-201ENST00000457640 885 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 LYRM7-203ENST00000510516 604 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 AC016747.2-203ENST00000606876 289 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 NIFK-AS1-202ENST00000414554 1411 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 COA4-201ENST00000355693 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 OR4A18P-201ENST00000529103 1088 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 AC087273.2-201ENST00000519038 634 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXD11P31277 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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