Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA7P31268 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms