Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC27P30260 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC27P30260 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC27P30260 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC27P30260 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC27P30260 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC27P30260 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC27P30260 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC27P30260 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC27P30260 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC27P30260 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC27P30260 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC27P30260 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC27P30260 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC27P30260 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC27P30260 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC27P30260 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC27P30260 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC27P30260 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC27P30260 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDC27P30260 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDC27P30260 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDC27P30260 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDC27P30260 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDC27P30260 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDC27P30260 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC27P30260 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC27P30260 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC27P30260 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC27P30260 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC27P30260 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC27P30260 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC27P30260 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC27P30260 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC27P30260 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC27P30260 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC27P30260 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC27P30260 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC27P30260 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC27P30260 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC27P30260 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC27P30260 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC27P30260 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC27P30260 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC27P30260 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC27P30260 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC27P30260 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC27P30260 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC27P30260 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC27P30260 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC27P30260 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC27P30260 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC27P30260 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC27P30260 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC27P30260 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC27P30260 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC27P30260 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC27P30260 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC27P30260 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC27P30260 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC27P30260 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC27P30260 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC27P30260 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC27P30260 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC27P30260 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC27P30260 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC27P30260 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC27P30260 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC27P30260 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC27P30260 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC27P30260 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC27P30260 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC27P30260 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC27P30260 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC27P30260 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC27P30260 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC27P30260 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC27P30260 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC27P30260 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC27P30260 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC27P30260 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC27P30260 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC27P30260 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC27P30260 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC27P30260 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC27P30260 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC27P30260 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC27P30260 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC27P30260 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC27P30260 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC27P30260 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC27P30260 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC27P30260 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC27P30260 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC27P30260 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC27P30260 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC27P30260 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC27P30260 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC27P30260 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC27P30260 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms