Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CMPK1P30085 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms