Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD10P28358 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms