Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms