Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMLP26374 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMLP26374 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMLP26374 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMLP26374 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMLP26374 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMLP26374 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMLP26374 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMLP26374 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMLP26374 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMLP26374 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMLP26374 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMLP26374 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMLP26374 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMLP26374 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMLP26374 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMLP26374 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMLP26374 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMLP26374 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMLP26374 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMLP26374 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMLP26374 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMLP26374 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMLP26374 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMLP26374 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMLP26374 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMLP26374 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMLP26374 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMLP26374 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMLP26374 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMLP26374 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMLP26374 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMLP26374 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMLP26374 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMLP26374 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMLP26374 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMLP26374 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMLP26374 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMLP26374 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMLP26374 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMLP26374 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMLP26374 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMLP26374 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMLP26374 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMLP26374 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMLP26374 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMLP26374 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMLP26374 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMLP26374 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMLP26374 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMLP26374 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMLP26374 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMLP26374 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMLP26374 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMLP26374 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMLP26374 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMLP26374 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMLP26374 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMLP26374 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMLP26374 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMLP26374 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMLP26374 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMLP26374 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMLP26374 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMLP26374 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMLP26374 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMLP26374 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMLP26374 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMLP26374 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMLP26374 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMLP26374 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMLP26374 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMLP26374 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMLP26374 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMLP26374 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMLP26374 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMLP26374 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMLP26374 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMLP26374 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMLP26374 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMLP26374 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMLP26374 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMLP26374 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMLP26374 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMLP26374 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMLP26374 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMLP26374 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMLP26374 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMLP26374 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMLP26374 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMLP26374 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CHMLP26374 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHMLP26374 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMLP26374 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMLP26374 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMLP26374 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMLP26374 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMLP26374 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMLP26374 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMLP26374 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms