Protein–RNA interactions for Protein: P25441

RPC53, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, yeast

Predictions only

Length 422 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC53	P25441	ITC1	YGL133W	3795 nt		3.17	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	ECM21	YBL101C	3354 nt		3.17	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	STN1	YDR082W	1485 nt		3.16	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	VHR2	YER064C	1518 nt		3.16	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	YFR057W	YFR057W	456 nt		3.16	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	PHD1	YKL043W	1101 nt		3.16	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	YKL115C	YKL115C	393 nt		3.16	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	DAD2	YKR083C	402 nt		3.16	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	YAL064W	YAL064W	285 nt		3.16	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	RPB8	YOR224C	441 nt		3.16	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	RFC5	YBR087W	1065 nt		3.16	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	CST9	YLR394W	1449 nt		3.16	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	RIF1	YBR275C	5751 nt		3.16	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	ILS1	YBL076C	3219 nt		3.15	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	SNQ2	YDR011W	4506 nt		3.15	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	ATC1	YDR184C	885 nt		3.15	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	EMI1	YDR512C	564 nt		3.15	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	YGL230C	YGL230C	444 nt		3.15	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	VMA7	YGR020C	357 nt		3.15	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	YHL048C-A	YHL048C-A	135 nt		3.15	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	CTK2	YJL006C	972 nt		3.15	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	SMA2	YML066C	1110 nt		3.15	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	YNL089C	YNL089C	477 nt		3.15	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	YPR050C	YPR050C	414 nt		3.15	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	VEL1	YGL258W	621 nt		3.14	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	YAL031W-A	YAL031W-A	309 nt		3.14	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	SRL3	YKR091W	741 nt		3.14	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	ATG10	YLL042C	504 nt		3.14	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	HAT1	YPL001W	1125 nt		3.14	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	YGL176C	YGL176C	1665 nt		3.14	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	DSE4	YNR067C	3354 nt		3.14	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	AVT2	YEL064C	1443 nt		3.13	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	UBP14	YBR058C	2346 nt		3.13	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	ERG25	YGR060W	930 nt		3.13	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	GOS1	YHL031C	672 nt		3.13	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	COX6	YHR051W	447 nt		3.13	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	NDL1	YLR254C	570 nt		3.13	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	YLR285C-A	YLR285C-A	171 nt		3.13	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	RPS30A	YLR287C-A	192 nt		3.13	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	SPC2	YML055W	537 nt		3.13	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	ADI1	YMR009W	540 nt		3.13	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	YNL043C	YNL043C	321 nt		3.13	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	YPL142C	YPL142C	318 nt		3.13	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	YBR090C	YBR090C	369 nt		3.13	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	NGG1	YDR176W	2109 nt		3.13	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	ERG11	YHR007C	1593 nt		3.12	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	NET1	YJL076W	3570 nt		3.12	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	HTB1	YDR224C	396 nt		3.12	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	DYN2	YDR424C	279 nt		3.12	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	HLR1	YDR528W	1272 nt		3.12	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	AST2	YER101C	1293 nt		3.12	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	YGL218W	YGL218W	651 nt		3.12	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	RSM27	YGR215W	333 nt		3.12	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	RPC40	YPR110C	1008 nt		3.12	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	YBR300C	YBR300C	498 nt		3.12	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	UTP5	YDR398W	1932 nt		3.12	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	SAG1	YJR004C	1953 nt		3.12	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	PBS2	YJL128C	2007 nt		3.12	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	HSE1	YHL002W	1359 nt		3.12	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	BPT1	YLL015W	4680 nt		3.11	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	RTG3	YBL103C	1461 nt		3.11	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	PUF6	YDR496C	1971 nt		3.11	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	ORC1	YML065W	2745 nt		3.11	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	YFL015C	YFL015C	495 nt		3.11	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	YGL039W	YGL039W	1047 nt		3.11	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	YHL002C-A	YHL002C-A	489 nt		3.11	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	CDC123	YLR215C	1083 nt		3.11	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	ATG3	YNR007C	933 nt		3.11	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	ARL1	YBR164C	552 nt		3.11	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	CBP2	YHL038C	1893 nt		3.11	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	ATG13	YPR185W	2217 nt		3.11	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	TSC11	YER093C	4293 nt		3.1	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	SIN3	YOL004W	4611 nt		3.1	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	RSM24	YDR175C	960 nt		3.1	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	ERP6	YGL002W	651 nt		3.1	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	ATG27	YJL178C	816 nt		3.1	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	MCR1	YKL150W	909 nt		3.1	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	YAL066W	YAL066W	309 nt		3.1	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	DYN3	YMR299C	939 nt		3.1	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	YOR385W	YOR385W	873 nt		3.1	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	RPL33A	YPL143W	324 nt		3.1	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	MRPL40	YPL173W	894 nt		3.1	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	YNL193W	YNL193W	1677 nt		3.1	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	BOI1	YBL085W	2943 nt		3.09	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	CCT7	YJL111W	1653 nt		3.09	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	YPR1	YDR368W	939 nt		3.09	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	RRT13	YER066W	558 nt		3.09	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	YFR054C	YFR054C	579 nt		3.09	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	PEF1	YGR058W	1008 nt		3.09	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	YGR160W	YGR160W	612 nt		3.09	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	YKL069W	YKL069W	543 nt		3.09	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	YNL226W	YNL226W	411 nt		3.09	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	THI80	YOR143C	960 nt		3.09	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	SFG1	YOR315W	1041 nt		3.09	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	YPR027C	YPR027C	834 nt		3.09	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	VAC8	YEL013W	1737 nt		3.09	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	MSB2	YGR014W	3921 nt		3.09	□□□□□ -1.91
RPC53	P25441	ARP5	YNL059C	2268 nt		3.09	□□□□□ -1.92
RPC53	P25441	CEP3	YMR168C	1827 nt		3.09	□□□□□ -1.92
RPC53	P25441	PSY2	YNL201C	2577 nt		3.08	□□□□□ -1.92

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