Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGA6P23229 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA6P23229 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms