Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMNB1P20700 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms