Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL3P19876 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms