Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD58P19256 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD58P19256 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD58P19256 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD58P19256 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD58P19256 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD58P19256 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD58P19256 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD58P19256 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD58P19256 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD58P19256 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD58P19256 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD58P19256 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD58P19256 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD58P19256 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD58P19256 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD58P19256 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CD58P19256 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD58P19256 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD58P19256 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD58P19256 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CD58P19256 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CD58P19256 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD58P19256 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD58P19256 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD58P19256 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD58P19256 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD58P19256 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD58P19256 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD58P19256 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD58P19256 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD58P19256 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD58P19256 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CD58P19256 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD58P19256 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD58P19256 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD58P19256 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD58P19256 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD58P19256 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD58P19256 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD58P19256 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD58P19256 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD58P19256 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD58P19256 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CD58P19256 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD58P19256 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD58P19256 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD58P19256 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD58P19256 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD58P19256 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD58P19256 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD58P19256 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD58P19256 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD58P19256 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD58P19256 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD58P19256 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD58P19256 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD58P19256 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD58P19256 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD58P19256 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD58P19256 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD58P19256 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD58P19256 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD58P19256 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CD58P19256 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD58P19256 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD58P19256 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CD58P19256 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CD58P19256 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD58P19256 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD58P19256 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD58P19256 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD58P19256 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD58P19256 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD58P19256 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD58P19256 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD58P19256 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD58P19256 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD58P19256 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD58P19256 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD58P19256 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD58P19256 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD58P19256 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD58P19256 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD58P19256 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD58P19256 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD58P19256 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD58P19256 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD58P19256 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD58P19256 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD58P19256 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD58P19256 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD58P19256 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CD58P19256 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD58P19256 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD58P19256 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD58P19256 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD58P19256 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD58P19256 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD58P19256 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms