Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL17P18621 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL17P18621 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL17P18621 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL17P18621 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL17P18621 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL17P18621 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL17P18621 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL17P18621 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL17P18621 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL17P18621 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL17P18621 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL17P18621 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL17P18621 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL17P18621 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL17P18621 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPL17P18621 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPL17P18621 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPL17P18621 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPL17P18621 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPL17P18621 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPL17P18621 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL17P18621 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL17P18621 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL17P18621 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL17P18621 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL17P18621 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL17P18621 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL17P18621 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL17P18621 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL17P18621 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL17P18621 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL17P18621 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL17P18621 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL17P18621 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL17P18621 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL17P18621 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL17P18621 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL17P18621 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL17P18621 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL17P18621 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL17P18621 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL17P18621 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL17P18621 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL17P18621 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL17P18621 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL17P18621 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL17P18621 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL17P18621 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL17P18621 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL17P18621 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL17P18621 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL17P18621 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL17P18621 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL17P18621 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL17P18621 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL17P18621 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL17P18621 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL17P18621 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL17P18621 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL17P18621 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL17P18621 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL17P18621 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL17P18621 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL17P18621 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL17P18621 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL17P18621 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL17P18621 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL17P18621 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL17P18621 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL17P18621 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL17P18621 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL17P18621 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL17P18621 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL17P18621 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL17P18621 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL17P18621 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL17P18621 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL17P18621 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL17P18621 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL17P18621 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL17P18621 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL17P18621 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL17P18621 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL17P18621 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL17P18621 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL17P18621 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL17P18621 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL17P18621 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL17P18621 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL17P18621 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL17P18621 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL17P18621 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL17P18621 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL17P18621 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL17P18621 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL17P18621 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL17P18621 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL17P18621 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL17P18621 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms