Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPCAMP16422 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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