Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA1P15976 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA1P15976 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA1P15976 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA1P15976 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA1P15976 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA1P15976 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA1P15976 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA1P15976 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA1P15976 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA1P15976 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA1P15976 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA1P15976 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA1P15976 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA1P15976 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA1P15976 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA1P15976 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA1P15976 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA1P15976 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA1P15976 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA1P15976 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA1P15976 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA1P15976 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA1P15976 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA1P15976 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA1P15976 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA1P15976 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA1P15976 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA1P15976 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA1P15976 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA1P15976 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA1P15976 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA1P15976 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA1P15976 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA1P15976 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA1P15976 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA1P15976 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA1P15976 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA1P15976 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA1P15976 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA1P15976 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA1P15976 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA1P15976 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA1P15976 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA1P15976 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA1P15976 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA1P15976 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA1P15976 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA1P15976 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA1P15976 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA1P15976 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA1P15976 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA1P15976 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA1P15976 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA1P15976 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA1P15976 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA1P15976 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA1P15976 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA1P15976 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA1P15976 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA1P15976 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA1P15976 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA1P15976 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA1P15976 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA1P15976 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA1P15976 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA1P15976 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA1P15976 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA1P15976 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA1P15976 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA1P15976 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA1P15976 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA1P15976 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA1P15976 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA1P15976 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA1P15976 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA1P15976 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA1P15976 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA1P15976 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA1P15976 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA1P15976 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA1P15976 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA1P15976 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA1P15976 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA1P15976 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA1P15976 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA1P15976 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA1P15976 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA1P15976 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA1P15976 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA1P15976 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA1P15976 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA1P15976 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA1P15976 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA1P15976 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA1P15976 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA1P15976 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA1P15976 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA1P15976 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATA1P15976 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms