Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD46P15529 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD46P15529 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD46P15529 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD46P15529 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD46P15529 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD46P15529 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD46P15529 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD46P15529 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD46P15529 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD46P15529 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD46P15529 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD46P15529 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD46P15529 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD46P15529 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD46P15529 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD46P15529 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD46P15529 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD46P15529 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD46P15529 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD46P15529 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD46P15529 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD46P15529 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD46P15529 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CD46P15529 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD46P15529 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD46P15529 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD46P15529 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD46P15529 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD46P15529 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD46P15529 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD46P15529 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD46P15529 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD46P15529 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD46P15529 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD46P15529 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD46P15529 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD46P15529 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD46P15529 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD46P15529 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD46P15529 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD46P15529 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD46P15529 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD46P15529 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CD46P15529 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CD46P15529 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD46P15529 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD46P15529 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CD46P15529 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CD46P15529 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD46P15529 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD46P15529 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD46P15529 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CD46P15529 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD46P15529 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD46P15529 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD46P15529 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD46P15529 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD46P15529 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD46P15529 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD46P15529 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD46P15529 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD46P15529 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD46P15529 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD46P15529 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD46P15529 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD46P15529 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD46P15529 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CD46P15529 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD46P15529 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD46P15529 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD46P15529 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD46P15529 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD46P15529 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD46P15529 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD46P15529 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD46P15529 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD46P15529 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD46P15529 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD46P15529 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD46P15529 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD46P15529 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD46P15529 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD46P15529 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD46P15529 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD46P15529 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD46P15529 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD46P15529 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD46P15529 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD46P15529 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CD46P15529 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CD46P15529 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CD46P15529 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD46P15529 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD46P15529 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD46P15529 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD46P15529 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD46P15529 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD46P15529 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD46P15529 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms