Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXB1P14653 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB1P14653 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB1P14653 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB1P14653 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB1P14653 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB1P14653 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB1P14653 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB1P14653 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB1P14653 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB1P14653 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB1P14653 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB1P14653 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB1P14653 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB1P14653 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB1P14653 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB1P14653 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB1P14653 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms