Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT10P13645 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT10P13645 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT10P13645 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT10P13645 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT10P13645 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT10P13645 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT10P13645 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT10P13645 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT10P13645 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT10P13645 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT10P13645 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT10P13645 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT10P13645 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT10P13645 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT10P13645 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT10P13645 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT10P13645 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT10P13645 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT10P13645 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT10P13645 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT10P13645 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT10P13645 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT10P13645 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT10P13645 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT10P13645 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT10P13645 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT10P13645 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT10P13645 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT10P13645 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT10P13645 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT10P13645 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT10P13645 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT10P13645 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT10P13645 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT10P13645 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT10P13645 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT10P13645 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT10P13645 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT10P13645 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT10P13645 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT10P13645 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT10P13645 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT10P13645 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT10P13645 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT10P13645 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT10P13645 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT10P13645 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT10P13645 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT10P13645 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT10P13645 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT10P13645 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT10P13645 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT10P13645 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT10P13645 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT10P13645 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT10P13645 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT10P13645 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT10P13645 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT10P13645 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT10P13645 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT10P13645 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT10P13645 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT10P13645 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT10P13645 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT10P13645 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT10P13645 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT10P13645 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT10P13645 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT10P13645 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT10P13645 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT10P13645 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT10P13645 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT10P13645 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT10P13645 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT10P13645 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT10P13645 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT10P13645 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT10P13645 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT10P13645 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT10P13645 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT10P13645 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT10P13645 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT10P13645 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT10P13645 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT10P13645 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT10P13645 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT10P13645 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT10P13645 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT10P13645 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT10P13645 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT10P13645 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT10P13645 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT10P13645 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT10P13645 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT10P13645 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT10P13645 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT10P13645 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KRT10P13645 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT10P13645 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms