Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ITGA4P13612 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA4P13612 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms