Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms