Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RARBP10826 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARBP10826 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARBP10826 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARBP10826 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARBP10826 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARBP10826 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARBP10826 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARBP10826 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARBP10826 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARBP10826 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RARBP10826 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARBP10826 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARBP10826 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARBP10826 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARBP10826 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARBP10826 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARBP10826 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARBP10826 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARBP10826 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARBP10826 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARBP10826 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARBP10826 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARBP10826 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARBP10826 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARBP10826 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARBP10826 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARBP10826 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARBP10826 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARBP10826 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARBP10826 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARBP10826 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARBP10826 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARBP10826 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARBP10826 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RARBP10826 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARBP10826 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARBP10826 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARBP10826 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARBP10826 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARBP10826 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARBP10826 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARBP10826 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARBP10826 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARBP10826 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARBP10826 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARBP10826 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARBP10826 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARBP10826 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARBP10826 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARBP10826 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARBP10826 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARBP10826 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARBP10826 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARBP10826 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARBP10826 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARBP10826 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARBP10826 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARBP10826 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARBP10826 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARBP10826 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARBP10826 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARBP10826 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARBP10826 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARBP10826 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARBP10826 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARBP10826 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARBP10826 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARBP10826 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARBP10826 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARBP10826 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARBP10826 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARBP10826 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARBP10826 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARBP10826 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARBP10826 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARBP10826 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARBP10826 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RARBP10826 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARBP10826 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARBP10826 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARBP10826 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARBP10826 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARBP10826 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RARBP10826 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARBP10826 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARBP10826 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARBP10826 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARBP10826 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARBP10826 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARBP10826 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARBP10826 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARBP10826 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RARBP10826 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARBP10826 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARBP10826 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARBP10826 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARBP10826 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARBP10826 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARBP10826 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms