Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR2F1P10589 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms